Одно из направлений работы гимназии «Самопознание»  – это организация научно-исследовательской деятельности. C 2009года учащиеся и учителя гимназии начали участвовать в Республиканских и Международных конкурсах и научных конференциях. На сегодняшний день наши учащиеся ведут исследования по следующим направлениям: математика, экономика, физика и астрономия, история, этнография, культурология, мировая художественная литература,химия, биология, литературоведение, языкознание,познание мира, валеология, самопознание.

Количество конкурсов, в которых наши ребята принимают участие, увеличилось до 26. Качество работ позволяет иметь высокие результатыне только на Республиканском, но и на Международном уровене.

Можно отметить, что участие наших учащихся в научно-исследовательских конференциях, конкурсах и олимпиадах позволяет осуществлять обмен и рапространение опыта в области науки и нравственно-духовного образования.

Научно-исследовательская деятельность дает учащимся возможность получения большого опыта публичных выступлений, получения сертификатов и дипломов для портфолио, а так же льгот при поступлении в ВУЗы Казахстана (поступление на грант) и за рубежом. В течении последних лет 23выпускника гимназии, ставших участниками и призерами Международных конкурсов, получили освобождения от сдачи итоговой аттестации в форме Единого Национального тестирования с правом получения сертификата ЕНТ, что является поощрением за вклад в развитие науки.